علاوه بر مهاجرت از ایران، جابهجاییهای داخلی نیز به یک نگرانی جدی تبدیل شده است. مرکز پژوهشهای مجلس در گزارشی به تجزیه و تحلیل وضعیت مهاجرتهای داخلی پرداخته است. براساس این گزارش، مهاجرتها بهویژه از نواحی مرزی به سمت مناطق مرکزی ازجمله مسایل اجتماعی و امنیتی کنونی کشور به شمار میرود.
مرکز پژوهشهای مجلس اعلام کرده است که در سه دهه اخیر، به طور تقریبی هر سال حدود یک میلیون نفر در داخل مرزهای کشور جابهجا شدهاند. این مهاجرت غالباً از نواحی کمتر توسعهیافته به سمت مناطقی با توسعه بیشتر اتفاق میافتد.
در سالهای اخیر، نسبت مهاجرتهای بین شهرداریها افزایش یافته و در عوض، میزان جابهجایی در روستاها کاهش پیدا کرده است. بیشتر جابهجاییهای داخلی به گروه سنی ۱۵ تا ۳۴ سال اختصاص دارد که این بازه سنی نمایانگر نیروی کار فعال کشور است.
تحلیل نسبت جنسی مهاجران بیانگر این است که جمعیت مردان در بین مهاجران غالب است. همچنین استانهای کرمانشاه، خوزستان و ایلام بهطور مداوم نرخ مهاجرت منفی بالایی را تجربه میکنند.