گوجه فرنگی نه تنها منبعی غنی از مواد مغذی برای بدن به شمار می‌رود، بلکه اثرات درمانی سودمندی نیز از خود به جای می‌گذارد. یکی از مهم‌ترین ترکیبات فعال موجود در این میوه، ماده‌ای به نام lycopene است که جزو کاروتنوئیدها به حساب می‌آید و رنگدانه‌ای قرمز است که رنگ متمایز گوجه فرنگی را به آن می‌بخشد.
مطالعات انجام شده نشان می‌دهند که گوجه فرنگی پخته، به ویژه در قالب سس گوجه فرنگی، در مقایسه با نمونه‌های خام، به طرز چشمگیری می‌تواند سبب افزایش جمعیت باکتری مفید Lactobacillus reuteri و فعالیت آن در روده شود. علاوه بر این، فرایند پخت موجب می‌گردد تا مقدار بیشتری از lycopene از گوجه فرنگی به بدن جذب گردد، نسبت به زمانی که این میوه خام مصرف شود.