آژانس بین‌المللی انرژی اتمی در پیامی که در شبکه اجتماعی «ایکس» منتشر کرد، اعلام نمود که «تیم بازرسان آژانس، پس از اقامت در تهران در زمان درگیری‌های نظامی اخیر، امروز با سلامت ایران را ترک کرده و به مقر خود در وین باز می‌گردند.»
در گزارشی از خبرگزاری مهر، گفته شده که رسانه وال‌استریت‌ژورنال در خبری اختصاصی اشاره کرده که پس از توقف همکاری تهران با آژانس بین‌المللی انرژی اتمی، این سازمان در حال خارج کردن تیم‌های بازرسی خود از کشور است.
طبق ادعای وال‌استریت، این اقدام به دلیل نگرانی‌های امنیتی انجام شده و بازرسان به شعبه آژانس در وین باز می‌گردند.
رافائل گروسی، مدیرکل آژانس، بدون اشاره به نقش این نهاد و گزارشی که به صدور قطعنامه‌ای علیه ایران در شورای حکام منجر شد، در زمان خروج بازرسان از کشور بیان کرد که اقدام «حیاتی» بعدی، آغاز مذاکرات با ایران به منظور تسهیل بازگشت بازرسان و از سرگیری «نظارت ضروری و راستی‌آزمایی برنامه هسته‌ای ایران» خواهد بود.
آژانس بین‌المللی انرژی اتمی در تاریخ دهم خرداد گزارشی محرمانه منتشر کرد که در آن تکرار ادعاهایی درباره ذخایر اورانیوم غنی‌شده در «سطح تسلیحاتی» ایران به چشم می‌خورد و از تهران خواسته شده که همکاری کامل و مؤثری با آژانس داشته باشد. این گزارش در زمان حساسی منتشر شد که مذاکرات تهران و واشنگتن درباره برنامه هسته‌ای ایران در حال انجام بود. به گفته این گزارش، ایران تا تاریخ ۱۷ مه (۲۷ اردیبهشت) ۴۰۸.۶ کیلوگرم اورانیوم را با غنای ۶۰ درصد تولید کرده است که نشان‌دهنده افزایش ۱۳۳.۸ کیلوگرم نسبت به آخرین گزارش آژانس در فوریه است.
پس از انتشار این گزارش، شورای حکام با صدور قطعنامه‌ای علیه ایران، به تقویت تجاوزات رژیم صهیونیستی و آمریکا علیه کشورمان کمک کرد. گروسی در پی ناکامی حمله رژیم صهیونیستی به ایران و پاسخ‌های قاطع تهران، ادعا کرد که آخرین گزارش او دلیل اصلی این تجاوزات نیست. او با همدستی صریح رژیم صهیونیستی و همچنین آمریکا و سه کشور اروپایی شامل انگلیس، فرانسه و آلمان، با ارائه این گزارش نادرست، زمینه را برای حملات رژیم صهیونیستی به خاک و تأسیسات صلح‌آمیز ایران فراهم کرد؛ گزارشی که چند روز پس از حمله تل‌آویو خلاف آن را اعلام و تأکید کرد که «آژانس هیچ نشانه‌ای دال بر تلاش ایران برای دستیابی به سلاح هسته‌ای مشاهده نکرده است.»
پس از این تجاوزات، در نشست علنی چهارشنبه-چهارم تیرماه- مجلس شورای اسلامی، نمایندگان در بررسی تقاضای اولویت تعدادی از نمایندگان برای گزارش کمیسیون امنیت ملی و سیاست خارجی در رابطه با طرح الزام دولت به تعلیق همکاری با آژانس بین‌المللی انرژی اتمی، با کسب ۲۱۰ رأی موافق، ۲ رأی مخالف و ۲ رأی ممتنع از مجموع ۲۱۹ نفر حاضر در جلسه، با این درخواست موافقت کردند. همچنین مسعود پزشکیان در تاریخ ۱۱ تیر، قانون الزام دولت به تعلیق همکاری با آژانس بین‌المللی انرژی اتمی را به سازمان انرژی اتمی، شورای‌عالی امنیت ملی و وزارت امور خارجه ابلاغ نمود.
310310