در پی این انفجار، محمدعلی رجایی، رئیس‌جمهور، و محمدجواد باهنر، نخست‌وزیر از جمله قربانیان بودند. همچنین عبدالحسین دفتریان، مدیرکل مالی اداری نخست‌وزیری به دلیل خفگی در آسانسور جان خود را از دست داد و یک زن سالخورده که در نزدیکی ساختمان بود نیز کشته شد.
شش روز پس از وقوع این حادثه، هوشنگ وحید دستجردی، رئیس وقت شهربانی ایران که در آن جلسه حاضر بود، به علت شدت جراحات ناشی از سوختگی فوت کرد. خسرو تهرانی، معاون امنیتی نخست‌وزیری نیز در اثر این بمب‌گذاری دچار سوختگی شد.