طبق برنامه اعتبار مالیاتی صنایع بزرگ، شرکت‌هایی که سهم سرمایه ثبتی آن‌ها یک‌سی‌ام از سرمایه صندوق نوآوری و شکوفایی باشد و همچنین شرکت‌هایی که در آخرین اظهارنامه مالیاتی خود درآمد عملیاتی بیش از ۵۰۰ میلیارد تومان ثبت کرده‌اند، مشمول حمایت‌های ماده ۱۱ قانون جهش تولید دانش بنیان خواهند شد.
حرکت به سوی اقتصاد دانش بنیان نیازمند ارتقاء و تقویت فعالیت‌های تحقیق و توسعه در صنایع مختلف کشور و همچنین بهره‌گیری حداکثری از ظرفیت‌های فناوری موجود برای برآورده ساختن نیازهای کشور است.
یکی از مؤلفه‌های اساسی در گسترش اقتصاد دانش بنیان در کشور، قانون جهش تولید دانش بنیان مصوب سال ۱۴۰۱ به شمار می‌آید که ابزارهای حمایتی مانند اعتبار مالیاتی تحقیق و توسعه موضوع بند ب ماده ۱۱ قانون را ایجاد کرده و فرصتی مناسب برای شرکت‌ها و صنایع بزرگ فراهم آورده است تا سهم فعالیت‌های تحقیق و توسعه را افزایش دهند.
در ماده ۱۱ قانون جهش تولید دانش بنیان تصریح شده است:
با هدف جهت‌دهی حمایت‌های مالیاتی به سمت توسعه نوآوری و اقتصاد دانش بنیان
الف ـ در ماده (۱۴۱) قانون مالیات‌های مستقیم، لغت «وکالاهای واسطه‌ای نیمه خام» پس از عبارات «بیست درصد (۲۰ درصد) درآمد حاصل از صادرات مواد خام» و «فهرست مواد خام و کالاهای نفتی» افزوده می‌شود.
ب ـ هزینه‌های انجام شده برای فعالیت‌های تحقیق و توسعه به عنوان اعتبار مالیاتی با قابلیت انتقال به سال‌های آتی به شرکت‌ها و مؤسسات درخواست‌دهنده اعطا شده و معادل آن از مالیات قطعی‌شده در سال انجام هزینه یا سال‌های بعد کسر خواهد شد.
از سال ۱۴۰۲ با اجرایی شدن برنامه اعتبار مالیاتی، گروهی از صنایع موفق به تعریف پروژه و بهره‌مندی از این حمایت شده‌اند. با این حال، دستیابی به حداکثر ظرفیت‌های اعتبار مالیاتی در میان صنایع بزرگ نیازمند ایجاد تعامل بیشتر با این شرکت‌ها برای کمک به شناسایی پروژه‌های فناورانه و نوآورانه‌ای است که قابلیت دریافت اعتبار مالیاتی را دارند.
دبیرخانه برنامه اعتبار مالیاتی به منظور به کارگیری حداکثری توانمندی‌های شرکت‌های بزرگ و صنایع کشور در جهت رفع نیازهای اولویت‌دار از طریق بهره‌برداری از ابزار اعتبار مالیاتی فعالیت می‌کند.
این برنامه ویژه به‌طور مستقل از برنامه عمومی اجرا شده و مسیر مخصوص، تعاملی و تسهیل‌شده‌ای برای همکاری با صنایع بزرگ در راستای تعریف پروژه‌های تحقیق و توسعه که شرایط اعتبار مالیاتی را دارا باشند، فراهم کرده است.
از جمله اهداف برنامه اعتبار مالیاتی اختصاصی صنایع بزرگ، “ارتقاء تحقیق و توسعه در صنایع کشور و افزایش هزینه‌های تحقیق و توسعه شرکت‌های صنعتی”، “تعامل نزدیک‌تر با مدیران تحقیق و توسعه در صنایع مختلف برای گسترش پروژه‌های تحقیق و توسعه مشمول اعتبار مالیاتی”، “هدفمند سازی فعالیت‌های تحقیق و توسعه در بنگاه‌های بزرگ صنعتی برای اجرای پروژه‌های تحقیق و توسعه اولویت‌دار” و “شناسایی و رفع نیازهای فناورانه صنایع بزرگ از طریق تعریف پروژه‌های تحقیق و توسعه” می‌باشد.
این برنامه به اعضای شبکه ملی مدیران تحقیق و توسعه و نوآوری کشور، شرکت‌هایی که دارای سرمایه ثبتی یک سی‌ام از سرمایه صندوق نوآوری و شکوفایی هستند و همچنین شرکت‌هایی با درآمد عملیاتی بیش از ۵۰۰ میلیارد تومان در آخرین اظهارنامه مالیاتی تعلق می‌گیرد.
برنامه حمایتی اعتبار مالیاتی صنایع بزرگ در چهار بخش “فرآیند تعاملی با شرکت‌ها برای تعریف پروژه‌های تحقیق و توسعه مشمول اعتبار مالیاتی”، “فرآیند تسهیل و تسریع ارزیابی”، “ظرفیت جذب نیروی انسانی مازاد برای ایجاد و توسعه واحد تحقیق و توسعه” و “برقراری ارتباط مستقیم و اختصاصی با دبیرخانه اعتبار مالیاتی” تعریف شده است.
در بخش حمایت‌های فرآیند تسهیل و تسریع ارزیابی، امکاناتی نظیر ارزیابی سریع پروژه‌ها و اعلام نتیجه حداکثر یک ماه پس از ارسال پرسشنامه، مرور پروژه‌های تأیید نشده و امکان اصلاح و بازتعریف پروژه‌های رد شده، و همچنین امکان ارائه پروپوزال‌های پروژه در طول سال خارج از زمان‌بندی فراخوان‌های عمومی در نظر گرفته شده است.
تامین پیشنهاد محورهای موضوعی اولویت‌دار برای شرکت‌ها در راستای تعریف پروژه‌های تحقیق و توسعه، معرفی شرکت‌های دانش بنیان معتبر برای رفع نیازهای فنی شرکت، یاری‌رسانی در تدوین استراتژی رشد تحقیق و توسعه در شرکت، و راهنمایی برای استفاده از دیگر ابزارهای حمایتی در اجرای پروژه‌های تحقیق و توسعه از جمله خدمات دبیرخانه اعتبار مالیاتی در بخش فرآیند تعامل با شرکت‌ها به‌شمار می‌رود.